Le médecin du travail anime et coordonne l’équipe pluridisciplinaire du service de médecine préventive, chargée d’assurer la prévention des risques professionnels et d’améliorer les conditions de travail des agents.
Il définit un protocole formalisé qui fixe les objectifs et les modalités de fonctionnement du service de médecine préventive, applicable à tous les professionnels qui y interviennent.
Il exerce une surveillance médicale des agents lors des visites médicales. Son rôle est de vérifier que la santé de l'agent est compatible avec l'exercice de ses missions. Pour les postes à risque, il vérifie que ceux-ci n’altèrent pas l'état de santé de l'agent via une surveillance médicale renforcée.
Il mène des actions en milieu de travail : analyses des postes, participation à l’évaluation des risques, observations du milieu professionnel, et propositions d’amélioration visant à prévenir les accidents et maladies professionnelles.
Il conseille l’autorité territoriale pour l’amélioration des conditions de travail de l'ensemble des agents.